Έντονα είναι τα προβλήματα που αντιμετωπίζουν ορισμένες σχολές, από την αναστολή των εργασιών καθαριότητας, φύλαξης και συντήρησης των χώρων του ιδρύματος. >>>
Ειδικότερα υπάρχουν σοβαρά λειτουργικά προβλήματα στην ιατρική σχολή όπου διατηρούνται πειραματόζωα, δεδομένα μικροβιολογίας και ιοί αλλά και στην οδοντιατρική σχολή που κάθε χρόνο δέχεται 14.000 ασθενείς.  

Επίσης σταμάτησε η πρακτική άσκηση των φοιτητών της Κτηνιατρικής Σχολής καθώς ανεστάλη η λειτουργία των κλινικών της, ενώ άρχισαν και οι διακοπές στην πρόσβαση της ακαδημαϊκής κοινότητας στις επιστημονικές διεθνείς βάσεις δεδομένων λόγω έλλειψης των απαραίτητων κονδυλίων.
Σημειώνεται ότι σήμερα και αύριο, Παρασκευή αναστέλλεται η λειτουργία του ιδρύματος σε μια συμβολική κίνηση δημοσιοποίησης των ζητημάτων που αντιμετωπίζει.
Χθες, σε συνέντευξη Τύπου, ο πρύτανης του ΑΠΘ, Γιάννης Μυλόπουλος, πρότεινε ως λύση τη μεταφοράς των εργαζομένων στις εργολαβίες του ΑΠΘ, στην Εταιρεία Αξιοποίησης και Διαχείρισης της Περιουσίας του, μέσω συμβάσεων. Είπε πως πιστεύει ότι τη λύση αυτή θα στηρίξει και η  σύνοδος των πρυτάνεων που θα πραγματοποιηθεί το ερχόμενο Σάββατο στη Θεσσαλονίκη.
Υποστήριξε ότι έτσι παρακάμπτονται οι εργολάβοι και εξοικονομούνται πόροι από την αμοιβή τους αλλά και από την πληρωμή του ΦΠΑ.  Όπως ανακοίνωσε, αναμένει συναντήσεις με τις ηγεσίες των υπουργείων Παιδείας και Εργασίας.
Πέρα από την ανάγκη θεσμικής επίλυσης του προβλήματος των εργολαβιών, οι εκπρόσωποι της Συγκλήτου ζήτησαν την καταβολή πρόσθετης επιχορήγησης 8 εκ. ευρώ περίπου για να καλυφθούν οι ανάγκες του ΑΠΘ για το υπόλοιπο του 2012. 
Απευθυνόμενος στους εργαζόμενους στις εργολαβίες, ο κ. Μυλόπουλος σχολίασε ότι αναγνωρίζει το δίκαιο των αιτημάτων τους ωστόσο τους κάλεσε να σταματήσουν την κατάληψη στο κτίριο διοίκησης (που συνεχίζεται για τρεις εβδομάδες) και να ορίσουν προσωπικό ασφαλείας για την κάλυψη των στοιχειωδών αναγκών καθαριότητας σε συγκεκριμένα τμήματα που έχουν αυξημένο πρόβλημα.