Το υπουργείο Μακεδονίας Θράκης ιδρύθηκε πριν 51 χρόνια. Αρχικά ονομάστηκε υπουργείο Βόρειας Ελλάδας. Επί πρωθυπουργίας Ανδρέα Παπανδρέου μετονομάστηκε σε υπουργείο Μακεδονίας Θράκης,για εθνικούς λόγους. Επί πρωθυπουργίας Γιώργου Παπανδρέου μετατράπηκε από υπουργείο σε γενική γραμματεία, προφανώς επειδή εξέλιπαν οι εθνικοί λόγοι.
Το υπουργείο Αιγαίου είχε μια παρόμοια πορεία. Ιδρύθηκε -κι αυτό- από τον Κώστα Σημίτη, κυρίως για εθνικούς λόγους. Μετατρέπεται -κι αυτό- από επίσης σοσιαλιστή πρωθυπουργό, σε γενική γραμματεία, προφανώς επειδή -και σ αυτήν την περίπτωση- εξέλιπαν οι λόγοι ύπαρξής του.
To Yπουργείο Μακεδονίας-Θράκης στεγαζόταν στο Διοικητήριο, ιστορικό, διατηρητέο κτίριο, σημείο αναφοράς, τοπόσημο της Θεσσαλονίκης, που κτίστηκε το 1891 από τον αρχιτέκτονα Βιταλιάνο Ποζέλι σε εκλεκτικιστικό ρυθμό. Κάποιος, κάποτε, είχε πει πως ιδρύθηκε για να... έχουν να καταλήγουν κάπου οι πορείες και να επιδίδουν ψηφίσματα. Φαίνεται πως της ίδιας άποψης είναι και ο πρωθυπουργός.