Λίγες ώρες μετά την επίθεση στο server του ΑΠΘ από ομάδα κουκουλοφόρων και κρανοφόρων, οπλισμένων με λοστούς, ακολούθησε εμπρηστική επίθεση (στις 19.05 το απόγευμα της Τετάρτης 1 Απριλίου 2009), έξω από την Πολυτεχνική Σχολή. Οι άγνωστοι εμπρηστές είχαν τοποθετήσει μηχανισμό αποτελούμενο από γκαζάκια κι ένα μπιτόνι βενζίνη, στον εξωτερικό τοίχο. Ευτυχώς, από τα γκαζάκια εξερράγη μόνον το ένα.